Protein–RNA interactions for Protein: P15514

AREG, Amphiregulin, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AREGP15514 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AREGP15514 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AREGP15514 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AREGP15514 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AREGP15514 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AREGP15514 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AREGP15514 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AREGP15514 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AREGP15514 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AREGP15514 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AREGP15514 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AREGP15514 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AREGP15514 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AREGP15514 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AREGP15514 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AREGP15514 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AREGP15514 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AREGP15514 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AREGP15514 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AREGP15514 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms