Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT13P13646 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT13P13646 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT13P13646 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT13P13646 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT13P13646 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT13P13646 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT13P13646 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT13P13646 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT13P13646 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT13P13646 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT13P13646 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT13P13646 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT13P13646 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT13P13646 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT13P13646 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT13P13646 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT13P13646 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT13P13646 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT13P13646 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT13P13646 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT13P13646 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT13P13646 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT13P13646 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT13P13646 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT13P13646 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms