Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARBP10826 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARBP10826 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RARBP10826 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARBP10826 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARBP10826 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARBP10826 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARBP10826 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARBP10826 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARBP10826 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARBP10826 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARBP10826 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RARBP10826 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARBP10826 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RARBP10826 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARBP10826 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RARBP10826 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARBP10826 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARBP10826 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RARBP10826 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARBP10826 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARBP10826 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms