Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL3P10147 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL3P10147 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL3P10147 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3P10147 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL3P10147 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL3P10147 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL3P10147 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL3P10147 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms