Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms