Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C4AP0C0L4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms