Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms