Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOA1P02647 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOA1P02647 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOA1P02647 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOA1P02647 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOA1P02647 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOA1P02647 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOA1P02647 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOA1P02647 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOA1P02647 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOA1P02647 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOA1P02647 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOA1P02647 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA1P02647 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA1P02647 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA1P02647 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA1P02647 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA1P02647 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA1P02647 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA1P02647 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA1P02647 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA1P02647 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA1P02647 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA1P02647 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA1P02647 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA1P02647 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA1P02647 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOA1P02647 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms