Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD4P01730 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD4P01730 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD4P01730 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD4P01730 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD4P01730 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD4P01730 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD4P01730 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD4P01730 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD4P01730 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD4P01730 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD4P01730 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD4P01730 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD4P01730 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD4P01730 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD4P01730 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD4P01730 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD4P01730 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD4P01730 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD4P01730 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD4P01730 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD4P01730 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD4P01730 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD4P01730 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD4P01730 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD4P01730 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD4P01730 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD4P01730 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD4P01730 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD4P01730 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD4P01730 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD4P01730 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD4P01730 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD4P01730 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD4P01730 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD4P01730 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD4P01730 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD4P01730 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD4P01730 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD4P01730 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD4P01730 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD4P01730 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD4P01730 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD4P01730 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD4P01730 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD4P01730 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD4P01730 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD4P01730 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD4P01730 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD4P01730 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD4P01730 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD4P01730 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD4P01730 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD4P01730 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD4P01730 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD4P01730 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD4P01730 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD4P01730 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD4P01730 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD4P01730 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD4P01730 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD4P01730 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD4P01730 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD4P01730 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms