Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX58O95786 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX58O95786 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX58O95786 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX58O95786 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX58O95786 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX58O95786 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX58O95786 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX58O95786 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX58O95786 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX58O95786 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX58O95786 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX58O95786 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX58O95786 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX58O95786 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX58O95786 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX58O95786 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX58O95786 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX58O95786 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX58O95786 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX58O95786 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX58O95786 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX58O95786 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX58O95786 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX58O95786 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX58O95786 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX58O95786 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX58O95786 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDX58O95786 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX58O95786 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX58O95786 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX58O95786 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX58O95786 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX58O95786 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX58O95786 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX58O95786 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX58O95786 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX58O95786 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX58O95786 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX58O95786 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX58O95786 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX58O95786 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX58O95786 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX58O95786 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX58O95786 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX58O95786 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX58O95786 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX58O95786 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms