Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL5O76039 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms