Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ABCC9O60706 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC40.63■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC40.63■■■■■ 4.1
ABCC9O60706 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
ABCC9O60706 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms