Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TIMM8AO60220 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms