Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLOCKO15516 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms