Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FANCAO15360 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FANCAO15360 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FANCAO15360 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FANCAO15360 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FANCAO15360 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FANCAO15360 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FANCAO15360 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FANCAO15360 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FANCAO15360 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FANCAO15360 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FANCAO15360 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FANCAO15360 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FANCAO15360 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FANCAO15360 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
FANCAO15360 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FANCAO15360 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FANCAO15360 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FANCAO15360 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FANCAO15360 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FANCAO15360 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FANCAO15360 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FANCAO15360 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FANCAO15360 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FANCAO15360 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FANCAO15360 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FANCAO15360 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FANCAO15360 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FANCAO15360 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FANCAO15360 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FANCAO15360 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FANCAO15360 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FANCAO15360 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FANCAO15360 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FANCAO15360 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FANCAO15360 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FANCAO15360 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FANCAO15360 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FANCAO15360 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FANCAO15360 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FANCAO15360 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FANCAO15360 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FANCAO15360 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FANCAO15360 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FANCAO15360 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FANCAO15360 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
FANCAO15360 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FANCAO15360 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
FANCAO15360 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FANCAO15360 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FANCAO15360 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FANCAO15360 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
FANCAO15360 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
FANCAO15360 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FANCAO15360 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FANCAO15360 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FANCAO15360 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FANCAO15360 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FANCAO15360 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FANCAO15360 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FANCAO15360 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FANCAO15360 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FANCAO15360 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FANCAO15360 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FANCAO15360 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FANCAO15360 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FANCAO15360 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FANCAO15360 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FANCAO15360 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
FANCAO15360 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FANCAO15360 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FANCAO15360 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FANCAO15360 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FANCAO15360 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FANCAO15360 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FANCAO15360 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FANCAO15360 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FANCAO15360 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FANCAO15360 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
FANCAO15360 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FANCAO15360 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FANCAO15360 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FANCAO15360 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FANCAO15360 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FANCAO15360 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FANCAO15360 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FANCAO15360 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FANCAO15360 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FANCAO15360 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
FANCAO15360 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FANCAO15360 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
FANCAO15360 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FANCAO15360 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FANCAO15360 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FANCAO15360 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FANCAO15360 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FANCAO15360 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FANCAO15360 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FANCAO15360 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FANCAO15360 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms