Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
SYNJ2O15056 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYNJ2O15056 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms