Protein–RNA interactions for Protein: O14730

RIOK3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK3O14730 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIOK3O14730 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIOK3O14730 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIOK3O14730 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIOK3O14730 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIOK3O14730 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIOK3O14730 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIOK3O14730 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms