Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL13PA6NNM8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL13PA6NNM8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms