Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPOPA6NHQ4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPOPA6NHQ4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPOPA6NHQ4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPOPA6NHQ4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
EPOPA6NHQ4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPOPA6NHQ4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms