Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HELTA6NFD8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms