Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC144AA2RUR9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC144AA2RUR9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms