Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRGMA1A4Y4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms