Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F8A0AVK6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms