Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USH1CQ9Y6N9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USH1CQ9Y6N9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms