Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM9Q9Y5J7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM9Q9Y5J7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms