Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBE2J1Q9Y385 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2J1Q9Y385 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2J1Q9Y385 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2J1Q9Y385 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2J1Q9Y385 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2J1Q9Y385 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2J1Q9Y385 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms