Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIT1Q9Y2X7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GIT1Q9Y2X7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GIT1Q9Y2X7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GIT1Q9Y2X7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GIT1Q9Y2X7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIT1Q9Y2X7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIT1Q9Y2X7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIT1Q9Y2X7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms