Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS9D1Q9Y2B5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS9D1Q9Y2B5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VPS9D1Q9Y2B5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS9D1Q9Y2B5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms