Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC4Q9Y296 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms