Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAK1Q9UPV9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAK1Q9UPV9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms