Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLC12A4Q9UP95 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC12A4Q9UP95 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms