Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTF2Q9UNY4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTF2Q9UNY4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms