Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms