Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD4Q9ULV1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FZD4Q9ULV1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms