Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA2Q9UL42 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA2Q9UL42 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms