Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CROTQ9UKG9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms