Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms