Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEF1Q9UBV8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms