Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DKK2Q9UBU2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK2Q9UBU2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms