Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MSRB1Q9NZV6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MSRB1Q9NZV6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms