Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP1Q9NZU7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP1Q9NZU7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms