Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK12Q9NYV4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK12Q9NYV4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms