Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms