Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT84Q9NSB2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT84Q9NSB2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms