Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DLL4Q9NR61 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DLL4Q9NR61 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms