Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCB9Q9NP78 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms