Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX8Q9HC52 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX8Q9HC52 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms