Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX5Q9H2C1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX5Q9H2C1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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