Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDCBP2Q9H190 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDCBP2Q9H190 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms