Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CTDSP1Q9GZU7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP1Q9GZU7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms